浙江海洋学院在《自然·通讯》上发布大黄鱼全基因组测序

日前，由浙江海洋学院院长吴常文教授领衔，浙江海洋学院、上海交通大学、复旦大学等机构联合破译了大黄鱼全基因组测序，构建了大黄鱼基因组图谱，并成功解析其先天免疫系统基因组特征。11月19日，该研究成果发表在《自然·通讯》杂志上。这是继半滑舌鳎之后，我国公布的第二个海水鱼类的基因组图谱，也是世界上第一个石首科鱼类基因组图谱，揭开了我国大黄鱼基因组学研究的序幕。我国大黄鱼研究从此进入组学时代。

吴常文教授领衔的科研团队经过研究发现，大黄鱼基因组预估大小为728Mb,具有19362个蛋白质编码基因。系统发育树表明，大黄鱼在基因组组成、基因结构、序列同源性等方面与三刺鱼最为接近。通过对大黄鱼进行了高深度全基因测序、从头组装和分析，发现大黄鱼具有发育良好的先天免疫系统，形成了一套独特的免疫模式，部分基因在大黄鱼先天性免疫方面起重要作用。研究团队下一步研究将重点挖掘其他更多的免疫基因，阐明他们在免疫通路中的作用，解析他们在抗病力呈现中的权重，进而检测野生大黄鱼和养殖大黄鱼的免疫基因组成差异。

大黄鱼免疫基因信息地充分解析，将有助于发现与抗病力相关的免疫基因位点，通过这些免疫基因位点优良等位基因的聚合和选育，将有望培育出先天免疫能力强、抗病力高的大黄鱼抗病品系，解决养殖过程中大黄鱼病害频发的瓶颈问题。同时，除免疫性状外，通过基因组信息的挖掘，还可以发现更多与大黄鱼生长、抗逆、性成熟等生产性状有关的基因，新的研究可望大大提高养殖大黄鱼生产性能，促进今后大黄鱼增养殖产业的发展。

（来源：浙江省科技厅  作者：省自然科学基金办）